Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp48Q3V0C5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp48Q3V0C5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp48Q3V0C5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp48Q3V0C5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp48Q3V0C5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp48Q3V0C5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp48Q3V0C5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms