Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms