Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms