Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms