Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Arfgef3Q3UGY8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arfgef3Q3UGY8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms