Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Parp8Q3UD82 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms