Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms