Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Q3U6N9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Q3U6N9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Q3U6N9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q3U6N9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q3U6N9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q3U6N9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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