Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U595 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms