Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Rnf149Q3U2C5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Rnf149Q3U2C5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Rnf149Q3U2C5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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