Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ctdnep1Q3TP92 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ctdnep1Q3TP92 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ctdnep1Q3TP92 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ctdnep1Q3TP92 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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