Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms