Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms