Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms