Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms