Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms