Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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