Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms