Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms