Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms