Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms