Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GscQ02591 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GscQ02591 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GscQ02591 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GscQ02591 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GscQ02591 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GscQ02591 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GscQ02591 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GscQ02591 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GscQ02591 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GscQ02591 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GscQ02591 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GscQ02591 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GscQ02591 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GscQ02591 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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GscQ02591 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GscQ02591 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GscQ02591 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GscQ02591 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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GscQ02591 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GscQ02591 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GscQ02591 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GscQ02591 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GscQ02591 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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GscQ02591 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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GscQ02591 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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