Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms