Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms