Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms