Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
F8a1Q00558 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
F8a1Q00558 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms