Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scn1bP97952 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scn1bP97952 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scn1bP97952 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scn1bP97952 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scn1bP97952 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scn1bP97952 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Scn1bP97952 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Scn1bP97952 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms