Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AlkP97793 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AlkP97793 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AlkP97793 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AlkP97793 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AlkP97793 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AlkP97793 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AlkP97793 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlkP97793 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlkP97793 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlkP97793 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlkP97793 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms