Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms