Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LystP97412 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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LystP97412 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LystP97412 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LystP97412 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms