Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SmsP97355 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SmsP97355 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SmsP97355 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SmsP97355 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SmsP97355 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SmsP97355 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SmsP97355 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SmsP97355 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SmsP97355 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SmsP97355 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SmsP97355 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SmsP97355 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SmsP97355 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SmsP97355 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SmsP97355 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SmsP97355 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SmsP97355 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SmsP97355 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SmsP97355 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SmsP97355 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SmsP97355 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SmsP97355 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SmsP97355 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SmsP97355 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SmsP97355 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SmsP97355 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms