Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Otx1P80205 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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