Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms