Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms