Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms