Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrnp3P59055 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms