Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm2P58774 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm2P58774 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm2P58774 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm2P58774 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm2P58774 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm2P58774 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm2P58774 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm2P58774 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm2P58774 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm2P58774 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm2P58774 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tpm2P58774 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tpm2P58774 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tpm2P58774 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm2P58774 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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