Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P58686 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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P58686 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P58686 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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