Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpa1P57784 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms