Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms