Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NcanP55066 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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