Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TspoP50637 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TspoP50637 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TspoP50637 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TspoP50637 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TspoP50637 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TspoP50637 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TspoP50637 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TspoP50637 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
TspoP50637 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TspoP50637 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TspoP50637 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms