Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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LtbrP50284 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LtbrP50284 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LtbrP50284 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LtbrP50284 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LtbrP50284 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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LtbrP50284 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LtbrP50284 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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LtbrP50284 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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