Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rfx1P48377 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx1P48377 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx1P48377 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx1P48377 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx1P48377 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rfx1P48377 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rfx1P48377 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rfx1P48377 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rfx1P48377 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx1P48377 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rfx1P48377 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rfx1P48377 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rfx1P48377 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx1P48377 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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