Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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VdrP48281 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VdrP48281 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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VdrP48281 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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VdrP48281 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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VdrP48281 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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