Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms