Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Mmp9P41245 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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