Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flt1P35969 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt1P35969 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt1P35969 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt1P35969 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt1P35969 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt1P35969 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt1P35969 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Flt1P35969 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Flt1P35969 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Flt1P35969 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Flt1P35969 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Flt1P35969 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Flt1P35969 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Flt1P35969 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Flt1P35969 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Flt1P35969 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Flt1P35969 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Flt1P35969 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Flt1P35969 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms