Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab20P35295 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms