Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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